L'analyse formelle de concepts pour l'extraction de connaissances dans les données d'expression de gènes
نویسندگان
چکیده
Résumé. L’analyse formelle de concepts (AFC, Ganter et Wille (1999)) est une méthode pertinente d’extraction de connaissances à partir de données complexes d’expression de gènes (Blachon et al. (2007), Motameny et al. (2008)). Dans ce papier, nous proposons d’extraire des groupes de gènes partageant un comportement similaire montrant des changements “significatifs” à travers divers environnements biologiques, servant d’hypothèses à la fonction des gènes.
منابع مشابه
Extraction de concepts sous contraintes dans des données d'expression de gènes
L’une des activités les plus importantes en biologie est l’analyse des données d’expression de gènes. Les biologistes espèrent ainsi mieux comprendre les fonctions des gènes et leurs interactions. Nous étudions dans cet article une technique permettant d’aider à l’analyse de ces données d’expression : l’extraction de concepts sous contraintes. Pour cela, nous proposons d’extraire des fermés sou...
متن کاملUne méthode implicative pour l'analyse de données d'expression de gènes
Résumé. Nous présentons une méthode d'extraction d'associations basée sur l'analyse statistique implicative et la notion de rang. Nous avons adapté le concept d'intensité d'implication à des classements pour découvrir des relations partielles robustes vis à vis du bruit et des variations d’amplitude. Appliquée aux données de puces à ADN, cette méthode met en évidence des relations entre des for...
متن کاملCaractérisation et extraction de biclusters de valeurs similaires avec l'analyse de concepts triadiques
Résumé. Le biclustering de données numériques est devenu depuis le début des années 2000 une tâche importante d’analyse de données, particulièrement pour l’étude de données biologiques d’expression de gènes. Un bicluster représente une association forte entre un ensemble d’objets et un ensemble d’attributs dans une table de données numériques. Les biclusters de valeurs similaires peuvent être v...
متن کاملVers différents types de règles pour les données d'expression de gènes - application à des données de tumeurs mammaires
RÉSUMÉ. Les puces à ADN permettent de mesurer le niveau d’expression de milliers de gènes d’un tissu donné dans une seule expérience. De part la nature de ces données (beaucoup de gènes et peu d’expériences), de nouvelles techniques d’analyse de données de biopuces doivent être développées. Dans cet article, nous proposons une technique d’interprétation des données basée sur la notion de règles...
متن کاملConstruction d'attributs pour l'extraction de connaissances à partir de séquences biologiques
Résumé. Dans cet article nous étudions un problème de prétraitement de données : la construction d’attributs décrivant des séquences biologiques. Afin d’assurer l’extraction de connaissances à partir de séquences biologiques (ADN, ARN et protéines), tout système de fouille de données (datamining) se confronte à la représentation non habituelle de ce type de données. Une séquence biologique est ...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
دوره شماره
صفحات -
تاریخ انتشار 2009